BLANCO
-> П
« 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 ...24 25 »
.genetic_atlas
Я знаю, что уже немного поднадоели эти карты, но вот еще одна Happy Наконец сделал временную шкалу, еще чуть-чуть порефакторил код, сделал переключение вида "популяции/образцы" и продолжаю подключать EIGENSOFT и ALDER.
 

PS. Сегодня/завтра новости по пайке ;)
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 3 [ +2 ]
.genetic_atlas
Добавил временную шкалу, очистку списка и пару кнопок-заглушек для запуска стат. анализа. Совсем скоро уже можно будет передавать данные в ALDER и EIGENSOFT. Как только это будет готово, вы поймете зачем весь этот софт нужен Smile
 
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 0 [ +2 ]
.genetic_atlas
Более менее привёл код в порядок. Образцы можно искать и выделять. Теперь нужно добавить возможность очищать список отобранных образцов Smile Немного переписал парсер, чтобы он добавлял данные в редис и в эластик одновременно. Пока все выглядит всё еще страшненько, но уже вырисовывается то, что я хочу в итоге видеть %)
 
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 0 [ +2 ]
.esp8266
Для того, чтобы начать работать с wifi модулем esp8266, нужно прикупить еще пару нужных штук (если верить статье на гиктаймз). Первая - для того, чтобы подавать на esp8266 нужное напряжение, а вторая - для того, чтобы можно было произвести его первоначальную настройку через компьютер. Заказал обе штуки из Китая (257р за всё; доставка бесплатно). А сам wifi модуль обошелся в 163р.
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 0 [ 0 ]
.genetic_atlas
Поиск с elasticsearch'ем работает Smile Теперь нужно добавить временную шкалу и сделать отбор образцов из списка найденных.
 
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 0 [ +1 ]
.news
Какие новости:

  1. Отметил 25-летие Smile
  2. Получил из Китая wifi-платки ESP8266 (3 шт).
  3. Продолжаю работать над атласом.

Кстати, мне на др один добрый друг (vjjd) подарил паяльную станцию, так что может быть моя жуткая пайка станет немного симпатичнее. По крайней мере, я на это надеюсь Happy В общем, совсем скоро ждите новостей про атлас, wifi датчик температуры и всякое такое.
 
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 1 [ +1 ]
.development_process
Как и обещал, выкладываю небольшое видео процесса разработки. Тут использовал далеко не все кейсы. На днях запишу еще что-нибудь, если будет интересно Smile
 
Автор: Йакуд | O-- | .мыслей 9 [ +1 ]
.blanco
Ребят, я очень рад, что сюда снова стали ходить люди Happy Даже появляются новые пользователи! Я понимаю, что пока мы с Лёшей пишем о достаточно специфичных вещах, поэтому то, что вы приходите не смотря ни на что вдвойне приятно Smile
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 8 [ +1 ]
.genetic_atlas
В качестве источника "мета данных" (описание образцов: географическое расположение, популяция, пол и куча других) у меня обычные огроменные экселевские таблицы.
 
Для разных выборок эти таблицы имеют разный формат, разные колонки, и предначены они для людей. А нужно скормить всё это серверу в удобоваримом виде. Немного повоевал с регулярными выражениями, в итоге все-таки сплавил в redis и elastic-search пачку данных генотипирования - это около 2000 образцов (до этого были данные о полных геномах, там было около 300 образцов). И теперь, когда данные "внутри", пора заняться непосредственно поиском по ним.
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 0 [ +2 ]
.to_infinity_and_beyond
Недавно я писал про всякие онлайн курсы, которые собираюсь пройти. Введение в биоинформатику сегодня заканчивается. Пока набрал там 92 из 100 баллов (этого уже достаточно для получения сертификата с "отличием"), если будет не лень, то сегодня доделаю последние 8 баллов. Лёгкий и немного неряшливо сделанный курс, но авторы все равно молодцы. Удачи им в будущем с курсом.
 

Теперь наступила пора введения в Computer Science - CS50x. Уговорил еще двух человек проходить его вместе со мной Smile Если хотите - присоединяйтесь! Очень интересный и продуманный курс.
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 2 [ +1 ]