BLANCO
-> П
« 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...24 25 »
.geneticatlas
Очень страдаю от недостатка знаний в области верстки, потому что сама идея атласа заключается в том, чтобы он был удобным интерфейсом для хардкорных программ. Видимо, нужно все-таки пройти какой-нибудь курс по html и css.
В остальном, работа идет очень неплохо: атлас умеет готовить для суперкластера задания. Когда кластер выполняет эти задания, он отправляет на сервер атласа результат работы, а атлас уже (если не требуется дополнительной обработки) пересылает все пользователю на почту. Все достаточно прозрачно.
Если бы кто помог с версткой, то все атласом уже можно было нормально пользоваться Cry
 
Еще в лаборатории появляются интересные вопросы относительно "версионирования" образцов, потому  что над каждым набором можно произвести кучу операций и необходимо как-то отслеживать что конкретно было сделано, иначе можно будет попасть в неловкую ситуацию. Опять же, так, чтобы все это делалось как можно незаметнее для пользователя, потому что и так куча работы.
 
PS. Вот такие помидоры дорастают дома пока я в отъезде:
 
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 4 [ +2 ]
.с_кем_не_бывает
Иногда бывает такое, когда ловишь себя на мысли: "Что я здесь делаю? Как я сюда вообще попал?". Кажется, что ходишь каждый день на работу, все как обычно - ничего не успеваешь, хотя особенно ничего и не делаешь. И ничего не намечаешь. Одно слово - рутина. А потом "оп" и ты уже второй час летишь над бесконечным лесом где-то в центре Сибири. Моргнул, а в твою дверь в 4 утра ломится в зюзю пьяная тетка и при этом поет песни на непонятном языке и просит тебя взять её кровь. Ты подходишь двери сказать, чтобы она уходила, а оказывается, что ты с каким-то немцем идешь дождливым днем по кладбищу, на котором могилам по 300-400 лет. И пока ты пытаешься понять, как так получилось, тебе во вьетнамском ресторане приносят живого осьминога, а твой собеседник - 78-летний дедок из Канады - рассказывает тебе, что у некоторых дравидийцев агглютинативно-префиксные языки. Все ясно! Именно этот дедок, которого ты впервые встретил 3 часа назад, привез тебя именно в этот ресторан на машине, на которой несколько дней назад он сбил оленя, а значит когда стемнеет нужно будет идти пешком - фары разбиты. Ты приходишь в аэропорт, твой десятичасовой рейс совсем скоро, к счастью, ты подготовился к нему и, чтобы не было проблем на границе, заблаговременно выложил из своего багажа большую часть человеческих костей, оставил только зубы десятка человек. Но ты все равно нервничаешь. Сосед предлагает тебе хотя бы виски, чтобы расслабиться, потому что от травы ты отказался, ведь через час нужно идти на работу.
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 4 [ +2 ]
.geneticatlas
Бедный ноут - всего 4гб оперативной памяти. Не хватает даже для того, чтобы хранить в памяти таблицы с картами генотипирования (в базе ~6,500 человек и на каждого по ~600,000 "букв"). С номерами этих "букв" (SNP) в геноме как раз 4Гб. Приходится пересаживаться на потоки, которые stream'ы. Наверное, оно и к лучшему.
 
Буду теперь вас регулярно мучить новостями про атлас - крепитесь. Ну и фоток чуть-чуть постараюсь завтра выложить Smile
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 12 [ +2 ]
.geneticatlas
Я работаю в очень интересном заведении - там все очень "секьюрно". Например, у каждой двери имеется считывалка пропусков (пропуски бывают 3х видов: RFID, с магнитной полоской и со штрихкодом). Соответственно, в пропуске записаны все разрешения на двери, чтобы люди не ходили куда не положено %) Это я молчу про бесконечные камеры и прочие системы защиты.
Так вот, при разработке атласа мне нужно учитывать специфику заведения. То есть, я не могу дать атласу доступ к своему аккаунту на суперкластере просто сохранив пароль где-нибуь в sshpass. В итоге я сделал следующую систему:

  1. Пользователь работает с атласом, после чего результат работы атлас упаковывает в архив, а пользователю выдает его "токен" (32-символьная строка)
  2. Пользователь самостоятельно логинится на суперкластер по ssh
  3. И запускает скрипт, у которого в качестве единственного параметра этот токен
  4. Скрипт скачивает с атласа этот архив, распаковывает и делает все, что нужно (добавляет в планировщик задач кластера задания, которые ты подготовил).
  5. По выполнению задания сам кластер уведомляет пользователя о завершении анализа - все счастливы!

При желании пользователь может сам распаковать этот архив и посмотреть всю пачку заданий для кластера, которые там содержаться, чтобы убедиться, что ничего лишнего там нет. Но, специально для олдфагов, сам скрипт я назвал wishmaster Smile
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 3 [ +3 ]
.boston
Храм неподалеку от дома, где я живу. На фото этого не видно, но он достаточно большой - там где кончается та часть, что видна на фото, влево и вправо начинают отходить длинные боковые крылья. Очень эпично выглядит вечером в пасмурную погоду - прямо как в Diablo 2 Happy
 

Автор: stasundr | O-- | .мыслей 2 [ +3 ]
.boston
Очень много событий происходит сейчас (один сосед чего стоит) и еще больше работы, даже нет времени написать что-нибудь сюда. Но завтра выходной, так что постараюсь и время найти и фоток отобрать немного Smile
Занимаюсь атласом - прикручиваю его к гарвардскому суперкластеру. Чуть позже расскажу, что из этого получилось.
 
(А тем временем датчик температуры отправил уже больше 50,000 показаний Happy)
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 0 [ +3 ]
.boston
Привет!
 
Следующие два месяца проведу в Бостоне. Приехал сюда по работе (в том числе буду работать над генетическим атласом). В отличие от прошлого раза, в этот раз снимаю жилье сам. Пока немного волнуюсь, потому что документы на проживание еще не подписаны, но, надеюсь, что все будет хорошо.
 
Кроме работы над атласом, здесь должно быть проще и быстрее купить всякие интересные штуки вроде новых микроконтроллеров MSP432 или, например, можно заказать печатных плат, которые будут готовы буквально за несколько дней. В общем, постараюсь радовать вас интересными постами Happy
 
Опять же, если я могу ответить на какие-то ваши вопросы - пожалуйста, спрашивайте Smile
 
Рандом фото:
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 1 [ +2 ]
.water
Вот обещанное видео о создании wi-fi выключателя бытовых приборов. Немного фигни наговорил, надеюсь, вы мне это простите Happy Буду рад услышать ваши комментарии Smile
 
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 5 [ +4 ]
.water
Сделал ЛУТом плату и собрал все на ней (на предыдущем видео плохо видно, но там все собрано на макетке). Теперь со спокойным сердцем вставляю в розетку Smile Завтра загляну в хозмаг и куплю какой-нибудь дешевый тройник. Имплантирую эту плату в тройник и смогу управлять им через инет Happy
 
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 0 [ +2 ]
.water
Небольшая демонстрация "прототипа": ардуина управляет включением/выключением лампы. Лампе требуется некоторое время, чтобы разгореться, поэтому она запаздывает по отношению к светодиоду на ардуине. Видно, что все работает, только нужно собрать в нормальном корпусе с нормальной изоляцией и на нормальной плате.
 
Автор: stasundr | O-- | .мыслей 0 [ +3 ]